Сан-Франциско, 2015 год. Леон С. Кеннеди находится в поисках похищенного инженера-робототехника, в то время как Клэр Редфилд проводит исследование тела, которое стало жертвой гигантского укуса кита. В это же время Джилл Валентайн и Крис Редфилд занимаются расследованием необычных случаев заражения Т-вирусом, которые происходят по всему городу. Все жертвы имеют одну общую черту — они недавно посетили тюрьму-музей Алькатрас. Когда Клэр, Крис и Джилл отправляются на экскурсию в это место, они оказываются в центре вспышки вируса среди туристов.